[gerba]

L'outil de sélection est complètement indépendant des calques, il sélectionne soit une partie (au lasso, au rectangle, etc.), soit la totalité de ton document (cmd+A)... (excepté le ou les éléments verrouillés, ...ce qui est le but du verrouillage !).
Tu désélectionnes une partie ou tout le document (cmd+D). Les raccourcis cmd+A et cmd+D ne s'appliquent qu'à des sélections, pas à des calques...

Si tu fais (option+cmd+A), tu actives tous tes calques (...sauf ceux qui sont verrouillés), et tu les désactives en cliquant dans la palette Calque (pas de raccourci).

Il faut faire la distinction entre sélectionner un (ou plusieurs) élément(s) visuel(s) avec un sélection, et activer un (ou plusieurs) calque(s).
Je ne sais pas si c'est clair, mais c'est cohérent...